美國科學家設計出機器學習算法 輕松生成蛋白質的五維圖像
2022-11-04 08:17:37
來源:科技日報
美國華盛頓大學科學家設計出一種機器學習算法Deep-SMOLM,生成了蛋白質的五維(5D)圖像,包括單個分子的方向和位置等信息。相關研究發(fā)表于近期出版的《光學快報》雜志,有助于科學家更好地理解微小尺度下的生物學過程。
研究人員表示,這里的5D指的并非新的或隱藏的空間維度。他們設計出的新系統(tǒng)可分辨分子在三維空間中的方向以及在二維空間中的位置,也就是從一張有“噪音”的像素化圖像中提取出5個參數。為從看似簡單的光點中獲取這些額外的復雜信息,團隊設計出了機器學習算法Deep-SMOLM,而且增加了額外的步驟。

研究團隊稱,在實驗室進行的單分子成像往往非常“嘈雜”,包含“斑點”或波動,可能會導致圖像變得模糊不清。對于大多數機器學習神經網絡來說,有效地處理這種“噪音”可能非常復雜。鑒于此,研究團隊借助Deep-SMOLM處理圖像,還增加了一種“處理后”步驟,能直接計算第一個算法得到的結果。
在處理了數千張快照后,研究團隊得到了一幅“美麗的圖像”,它使用顏色、曲率和方向來昭示數千個分子是如何相互連接的。研究人員表示,這一系統(tǒng)將有助于更好地理解微小尺度的生物學過程,比如淀粉樣蛋白如何聚集形成與阿爾茨海默病相關的纏結結構等。
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